企业在设立时已经充分考虑了企业的形态，是公司制、合伙制还是其他组织形式，对股权结构也完成了思考，但中小企业往往忽视了企业设立时股东合作合同、章程等法律文件细节的推敲，为日后股权变化、利润分配以及重大事项调整埋下风险和隐患。
（2）合同签订问题
无论企业是作为甲方还是乙方，合同是企业最常见的法律文书，也是出问题最多的环节。有的企业合同过于简单，对方提供的合同也未经仔细审查就签字盖章，在发生争议时无法纠正对自己不利的合同条款。企业应当规范采购和销售的常用合同文本，规范管理合同。
（3）应收账款问题
发生拖欠的往往是长期合作的客户，双方合作关系一向很好，合同、收货单等往往企业都不是太在意，发生纠纷的时候一整理发现资料不全，催收应收账款时对方找各种理由拖延时间。企业应当规范应收帐款管理流程，设定各种情况的应对方案，必要时提交法院进行诉讼。
（4）劳资问题
中小企业往往忽视劳动合同的细节，如薪金待遇、合同的变更条件、保密条款、合同的期限等，未针对不同员工签订不同的劳动合同，容易产生劳资双方对合同的理解不一致。另外，工伤事务是生产型企业中常见的法律问题。
（5）诉讼与仲裁